在解剖学上，感染性心内膜炎的特点是融合了植被和破坏性病变：

1. 植被是一种附着在瓣膜结构上的振荡物，它与瓣膜相互独立运动，但也可能是处于异常位置的非振荡物。经胸超声回波的植被诊断灵敏度为75%，执行TOE 后可以提升至85–90%。但对于人工心脏瓣膜、以及影响起搏器之类的心内装置的感染性心内膜炎，TOE 的灵敏度会有所降低。
2. 脓肿一般是低回波密度瓣周区，里面没有检测到彩色血流，可能诱发假性动脉瘤和瘘管并发症（图XX9XX）。脓肿诊断TOE 灵敏度为90%，相比经胸回波有较高的附加值。
3. 其他破坏性病变可能包括瓣膜瘤、穿孔或脱垂、以及腱索或不太常见的乳头肌断裂。这些病变的主要后果是诱发重度瓣膜回流和心脏衰竭。TOE 对其评估非常有用。